Visando a promoção e a sistematização das atividades de Ensino, Pesquisa e Extensão da Uningá, desde o ano de 2010 a instituição passou a contar com um sistema online de submissão de projetos de Ensino, Pesquisa e Extensão, o que permitiu o registro e o acompanhamento das respectivas atividades desenvolvidas.

Atualmente a Uningá possui projetos de pesquisa financiados pelo CNPq (PIBIC-CNPq-Uningá), FUNDAÇÃO ARAUCÁRIA e aqueles financiados pela mantenedora da IES, como Programa de Iniciação Científica (PIC-Uningá) e os projetos de pesquisa executados por docentes e alunos do Programa de Mestrado em Odontologia.