O Programa de Mestrado Profissional em Odontologia do Centro Universitário Ingá foi aprovado pela Capes em 2007. Iniciou as atividades em 2008.

Atualmente, conta com 15 docentes permanentes, todos em regime integral, além de 3 professores colaboradores.

É constituído por três áreas de concentração: Ortodontia, Implantodontia e Prótese Dentária.